Análisis de secuencia de ADN

Endpoint

Ruta: https://us-central1-totemfunctions.cloudfunctions.net/analyzeDNASequence
Método: POST

Descripción

Este endpoint realiza un análisis detallado de una secuencia de ADN proporcionada. La función recupera la secuencia desde NCBI, realiza varios análisis bioinformáticos y genera recomendaciones basadas en los resultados.

Solicitud (Request)

Ejemplo de Cuerpo de Solicitud (JSON)

{
    "uid": "user123",
    "geneId": "NM_001301717"
}

Descripción de Parámetros

uid (string): Identificador del usuario que está realizando la solicitud. Se utiliza para verificar la autorización del usuario.
geneId (string): Identificador del gen o secuencia de ADN para el cual se desea realizar el análisis.

Errores Comunes

400 Bad Request: Si falta alguno de los parámetros uid o geneId.
403 Forbidden: Si el uid no está autorizado.
500 Internal Server Error: En caso de errores internos del servidor durante el procesamiento de la solicitud.

Respuesta (Response)

Ejemplo de Cuerpo de Respuesta (JSON)

{
    "message": "Result of DNA sequence analysis.",
    "sequence": "ATGCAGCTGATCAGCTGACTAG...",
    "result": {
        "length": 1234,
        "gcContent": 48.5,
        "atContent": 51.5,
        "nucleotideCounts": {
            "A": 500,
            "T": 400,
            "G": 200,
            "C": 134
        },
        "cpgIslands": [123, 456, 789],
        "repeats": {
            "AAAA": 5,
            "TTTT": 3
        },
        "meltingTemperature": 76.5,
        "openReadingFrames": [
            {
                "start": 0,
                "end": 150,
                "length": 150
            },
            {
                "start": 300,
                "end": 450,
                "length": 150
            }
        ]
    },
  "recommendations": "Explicación en lenguaje natural de los resultados"
}

Descripción de Campos

message (string): Mensaje que indica el resultado del análisis de la secuencia de ADN.
sequence (string): Secuencia de ADN analizada.
result (object): Resultados del análisis que incluyen:
- length (integer): Longitud total de la secuencia de ADN.
- gcContent (float): Contenido de GC de la secuencia en porcentaje.
- atContent (float): Contenido de AT de la secuencia en porcentaje.
- nucleotideCounts (object): Conteo de cada nucleótido en la secuencia.
  - A (integer): Conteo de adenina.
  - T (integer): Conteo de timina.
  - G (integer): Conteo de guanina.
  - C (integer): Conteo de citosina.
- cpgIslands (array of integers): Posiciones de islas CpG en la secuencia.
- repeats (object): Secuencias repetitivas encontradas en la secuencia.
  - Ejemplo: "AAAA": 5 indica que la secuencia "AAAA" se repite 5 veces.
- meltingTemperature (float): Temperatura de fusión (Tm) calculada para la secuencia.
- openReadingFrames (array of objects): Marcos de lectura abiertos (ORFs) identificados en la secuencia.
  - Cada objeto incluye:
    - start (integer): Posición de inicio del ORF.
    - end (integer): Posición de fin del ORF.
    - length (integer): Longitud del ORF.
recommendations (string): Recomendaciones detalladas generadas por OpenAI basadas en los resultados del análisis, incluyendo interpretación de resultados, implicaciones clínicas, recomendaciones para el uso de tecnologías como CRISPR-Cas9 y sugerencias para futuras investigaciones.

Notas Adicionales

El campo recommendations ofrece una interpretación profesional y detallada de los resultados del análisis, incluyendo posibles implicaciones clínicas y recomendaciones específicas para tecnologías emergentes.
La respuesta está diseñada para ser útil para profesionales de la salud y para la investigación genética, proporcionando información clara y útil para la toma de decisiones y futuras investigaciones.

Last modified: 26 agosto 2024