Análisis de secuencia de proteínas

Endpoint

Ruta: https://us-central1-totemfunctions.cloudfunctions.net/proteinAnalysis
Método: POST

Descripción

Este endpoint realiza un análisis detallado de una secuencia de proteínas proporcionada. La función recupera la secuencia desde NCBI, analiza características de la secuencia y genera recomendaciones basadas en los resultados.

Solicitud (Request)

Ejemplo de Cuerpo de Solicitud (JSON)

{
    "uid": "user123",
    "proteinId": "P12345"
}

Descripción de Parámetros

uid (string): Identificador del usuario que está realizando la solicitud. Se utiliza para verificar la autorización del usuario.
proteinId (string): Identificador de la proteína para el cual se desea obtener el análisis de la secuencia.

Errores Comunes

400 Bad Request: Si falta alguno de los parámetros uid o proteinId.
403 Forbidden: Si el uid no está autorizado.
500 Internal Server Error: En caso de errores internos del servidor durante el procesamiento de la solicitud.

Respuesta (Response)

Ejemplo de Cuerpo de Respuesta (JSON)

{
    "message": "Result of protein sequence analysis.",
    "proteinId": "P12345",
    "result": {
        "length": 350,
        "aminoAcidCounts": {
            "A": 50,
            "R": 30,
            "N": 20,
            "D": 25,
            "C": 15,
            "E": 40,
            "Q": 35,
            "G": 45,
            "H": 25,
            "I": 40,
            "L": 55,
            "K": 30,
            "M": 20,
            "F": 25,
            "P": 30,
            "S": 50,
            "T": 45,
            "W": 20,
            "Y": 25,
            "V": 30
        },
        "molecularWeight": 45000.0,
        "ptms": [
            {
                "position": 15,
                "type": "Phosphorylation"
            },
            {
                "position": 72,
                "type": "Phosphorylation"
            }
        ]
    },
  "recommendations": "Explicación en lenguaje natural de los resultados"
}

Descripción de Campos

message (string): Mensaje que indica el resultado del análisis de la secuencia de proteínas.
proteinId (string): Identificador de la proteína analizada.
result (object): Resultados del análisis que incluyen:
- length (integer): Longitud total de la secuencia de proteínas.
- aminoAcidCounts (object): Conteo de cada aminoácido en la secuencia.
  - Ejemplo: "A": 50 indica que el aminoácido Alanina (A) se encuentra 50 veces.
- molecularWeight (float): Peso molecular calculado para la proteína.
- ptms (array of objects): Modificaciones postraduccionales potenciales identificadas en la secuencia.
  - Cada objeto incluye:
    - position (integer): Posición de la modificación en la secuencia.
    - type (string): Tipo de modificación, como "Phosphorylation".
recommendations (string): Recomendaciones detalladas generadas por OpenAI basadas en los resultados del análisis, incluyendo interpretación de resultados, implicaciones clínicas, recomendaciones para el uso de tecnologías y sugerencias para investigaciones adicionales.

Notas Adicionales

El campo recommendations proporciona una interpretación profesional y detallada de los resultados del análisis, incluyendo posibles implicaciones clínicas y recomendaciones específicas para futuras investigaciones.
La respuesta está diseñada para ser útil tanto para profesionales de la salud como para investigadores en biología molecular, ofreciendo información clara y útil para la toma de decisiones y futuras investigaciones. to debería proporcionar una visión clara y completa del endpoint /proteinAnalysis, asegurando que los usuarios comprendan tanto la solicitud como la respuesta esperada. Si hay algo más que desees ajustar o agregar, estaré encantado de ayudarte.

Last modified: 26 agosto 2024